Po ujawnieniu całkowitej kontroli nad Wszechświatem Matoran, Makuta wysłał wojska Rahkshi do różnych miejsc, w tym Metru Nui, na Odinę i Daxia. To doprowadziło do zniszczenia całej wyspiy Daxia i rzezi wielu członków Zakonu Mata Nui. Teridax wyeliminował wszelkich Makuta, a pozostałe okręty Bractwa zatopił, żeby zapobiec przyszłym buntom. W międzyczasie Mroczni Łowcy przenieśli się na Xia w reakcji na atak na ich wyspę. W końcu większość ludności Metru Nui szukała schronienia w Archiwach. Toa Gali Nuva zniknęła na krótko w tym czasie, ale później została odnaleziona przez Kopakę i Lewę. Turaga odnaleźli zmiennokształtnego Rahi, Krahkę, który po raz kolejny zgodził się sprzymierzyć się z nimi. Krahka i Toa Nuva i udali się na Stelt, gdzie Trinuma poinformował zespół o zniszczeniu Daxii. Rozdzieleni, Takanuva i Pohatu przeszukiwali ruiny Destralu, gdzie otrzymali komunikat od Tahu o ataku na Odinę. Więcej informacji nadeszło później od Gali w Metru Nui, w sprawie ucieczki Ta-Matoranina, którego los był godny żałowania. Takanuva szybko znajduje się urządzenie, które teleportuje Destral z miejsca na miejsce, i zwróciła się o pomoc do Toa Mahri Nuparu. Tahu zleca Gali proszenie Wielkich Istot w nadziei na znalezienie sposobu na powsztrzymanie nowej robotycznej formy Teridaxa. Potem zostawił Onuę, żeby wzmocnił Archiwa i obronił mieszkańców wewnątrz.
Zespół składający się z Tahu, Kopeke, Johmak, Krahki, Guardiana, i Lariski wycofał się do Karzahni, gdzie planuje się spotkać z Onuą; Toa Nuva Ziemi ma kontakt z grupą ocalałych członków Zakonu Mata Nui. Po dyskusji drużyny Tahu na temat ich taktyki ratowania wszechświata, Guardian zginął po tym, jak ziemia go pochłonęła. Następnie legion Exo-Toa otoczył drużynę i Teridax przemówił do nich przez jednego z robotów. Zanim bitwa nastąpiła, ziemia rozstąpiła się i pogrzebała maszyny. Onua się pojawił i poinformował, że członkowie Zakonu, których szukali zostali zmiażdżeni przez Rahkshi. Następnie zasugerował, że zniszczą ostatnie źródło Energetycznego Protodermis, które znajduje się na Daxii, co zatrzyma produkcję Rahkshi. Grupa się zgodziła.
Na Południowych Wyspach, Axonn został na krótko uwięziony w iluzji Makuty, ale ostatecznie uwolnił się z niej z pomocą Kanohi Rode.
Lewa udał się do Artakhi szukających pomocy w powstrzymaniu inwazji Rahkshi, które zaczęły zajmować wyspy. Zamiast pomocy, Artahka teleportował go na wyspę Tren Kroma, wiedząc, że Lewa znajdzie tam pomocy.
W Metru Nui, Po-Matoranie zostali wyznaczeni do pracy przy rzeźbie Teridax. Siedmiu Turaga zostało złapanych i uwięzionych przez "Turagę" Ahkmou, który niedawno został mianowany tym tytułem przez Makutę. Toa Hagah nadal byli pod wpływem iluzji, myśleli, że Teridax został pokonany, bez względu na prośby Matoran. Teridax ponownie stworzył hordy Visoraków.
Ga-Matoranka Macku uciekła od swojej pracy i odkryła Toa Tuyet w Archiwach. Wysłała wiadomość do Hafu Kapura aby dołączyli do niej, a następnie przeniosła ich do Tuyet, który wyjaśniła, jak może pomóc. Hafu był sceptyczny co do sposobu w jaki Tuyet może im pomóc, zanim ujawniła, że nikt we wszechświecie nie wiedział, że żyje i że Kamień Nui.
Teridax kontroluje Wszechświat Matoran
Makuta Teridax był gotowy aby opuścić Aqua Magna, jednak miał zamiar najpierw stłumić wszystkie pozostałe bunty. Chciał wyśledzić Maskę Życia i zniszczyć Mata Nui'ego uwięzionego w środku. Tymczasem wyczuł przybycie innego Makuta we wszechświecie.
Na bezludnej części Południowego Kontynentu, członek Zakonu Mata Nui Mazeka i alternatywny Teridax zanleźli się na granicy terytorium niebezpiecznej rośliny, która może ich zaatakować jeśli będą zbyt blisko niej. Teridax wykorzystał swoje moce, aby wchłonąć światło wokół roślin, powodując ich śmierć. Ciekawski Mazeka spytał się go, jak istota kontrolująca światło może manipulować cieniem. Alternatywny Teridax odpowiedział mu z łatwością. Kontynuując podróży, Mazeka i alternatywny Teridax dotarli do Ba-Koro, byłego domu dla Ba-Matoran. Zanim wyszli z opuszczonej wioski, natrafili na zwłoki Visoraków. Teridax z Wszechświata Matoran mówił przez trupy, szydził, że nie może być pokonany przez słabszego wersji samego siebie, i teleportował trzech Mrocznych Takanuva do miejsca, gdzie byli Mazeka i alternatywny Teridax.
Na wyspie Tren Kroma, starożytna osoba wyczuła obecność Lewy, i postanowiła pomóc z rebelią zamieniając umysł z Lewą i szybko wyjść z jaskini w ciele Toa. Skontaktował się Artakhą i przekonał go, by teleportował go do Metru Nui. Następnie dołączył do Hafu, Kapury i Tuyet w Archiwach, zawczasu odkrywając tajemnice Tuyet. Wyszli na powierzchni i zauważyli Toa Pouksa i Bomongę. Wiedząc o ich ostatnim zachowaniu, Tren Krom wykrył iluzję nałożoną na Toa Hagah i używając swoich mocy uwolnił ich od psychicznego więzienia.
Wewnątrz Rdzenia Procesora, schwytana Toa Helryx skończyła mówiąc, że Matoranie są odpowiedzialni za zdrowie wszechświata. Jeśli jednak nie zdecydują się utrzymać robota, to przestanie działać. Zauważyła również, że jeśli Matoranie nie współpracowali, Teridax po prostu zabijał pracowników pojedynczo aż do ich zgodności z obawy o bezpieczeństwo swoich braci. W celu ratowania innych światów od rządów Teridaxa i zrozumieniu kosztu jej własnego świata, lider Zakonu Mata Nui postanowiła uwolnić Nova Blast, który zniszczyłby mechanizmy kontroli i spowodował zniszczenie wszechświata. Zanim mogła to zrobić, Tren Krom, Tuyet, Kapura i Hafu weszli do pokoju. Tren Krom zobaczył portret Miserixa, i rozwiał iluzję, uwalniając oryginalnym przywódcę Bractwa Makuta z jego psychicznego więzienia. Helryx wytłumaczyła Hafu i Kapurze aby wydostali się na zewnątrz i powiedzieli Matoranom żeby się uspokoili, a Tren Krom zaczął używać urządzeń łączności aby skontaktować się z Mata Nui'm. Inni zaczęli go pytać, ponieważ Axonn i Brutaka pojawili się w pokoju(???). Kiedy Axonn i Helryx zaczęli dyskutować, Tuyet podsłuchała wiadomość Tren Kroma, usłyszała słowa "Złota Zbroja" i "Ignika". Sześciu wojowników dyskutowało kilka chwil zanim wybrali strony; Axonn, Helryx i Miserix zgodzili się na zniszczenie wszechświata, a Tren Krom, Brutaka i Tuyet chcieli go ocalić. Podczas walki, która wtedy wybuchła, Helryx znalazła możliwość stworzenia Nova Blast, ale jej zamiar został przerwany przybyciem Artakhi. Po krótkiej kłótni z Tren Kromem, starożytny twórca(Crafter) zmusił go do opuszczenia ciała Lewy i umożliwił Toa Powietrza odzyskanie pierwotnej formy. Teridax przybył i zdecydował się interweniować poprzez niezwłoczne wysłanie wszystkich gości tego pokoju w próżnię przestrzeni kosmicznej, gdzie oglądali jak ich wszechświat odlatuje w kierunku planety Bara Magna.
Teridax leci na Bara Magna
Pięciu Toa Mahri przybyło na wyspę Zakaz. Ich misją było zbadanie, czy inny władca Skakdi chce zdetronizować Nektanna i połączyć siły z Makuta. Zakon Mata Nui odnotował również pięciu zmutowanych Piraka, którzy byli wcześniej przetrzymywani na Daxii, ale zaginęli i byli namawiani do przejścia na wyspię Zakaz. Toa w końcu udało się ominąć obronę twierdzy i wejść do jaskini, gdzie armia Skakdi planowała przejąć wszechświat. Nuparu ujawnił innym Toa, że istnieje coś wielkiego pod jaskinią i kilka chwil później olbrzymi zbiornik Energetycznego Protodermis wynurzył się spod ziemi. Następnie Skakdi przystąpili do zaciągnięcia trzech więźniów - Vortixx, Zyglaka, a pracownika z Steltu - i wrzucili ich do zbiornika. Mahri dyskutowali, że fuzja ludźmi z Energetycznym Protodermis prawdopodobnie jest pomysłem Teridaxa, który obsadził go w umyśle armii. Nagle Hahli zauważyła grupę Skakdi niosących pięć węży morskich, byli to Piraka. Następnie Skakdi wrzucili wszystkie osiem istot do srebrnej cieczy. Bez wiedzy Skakdi, zielonkawy obłok unosił się nad zbiornik i zagłębił się w niego. Toa i Skakdi patrzyli, jak Energetyczne Protodermis transformuje się, łącząc wszystkich wewnątrz zbiornika, a następnie pojawiła potworna istota. Nowa forma życia powiedziała do Skakdi żeby ją nakarmiły w prezencie. Skakdi byli roztargnieni, Toa Mahri zaczęli wykonywać swój ruch, ale nagle zatrzymali się, odłożyli broń, i podążyli za Skakdi.
W królestwie Karzahni, Barraki Pridak, Kalmah i Mantax zebrali swoje wojska do marszu na wyspę Metru Nui po tym jak TSO użyje wirusa na Teridaxie. Kiedy nic się nie stało, Pridak zniecierpliwił się i zdecydował się poprowadzić swe wojska do Metru Nui.
| Uwaga, Spoiler: Zapoznanie się z poniższymi materiałami może zmniejszyć lub całkowicie zlikwidować przyjemność wynikającą z poznawania historii! |
| Onua i Tahu próbowali złapać w pułapkę grupy Rahkshi, które wycofały się w ostatniej chwili, powodując zamieszanie między dwoma Toa. Następnie przybył członek Zakonu Mata Nui i poinformował ich, że wszystkie Rahkshi zostały wezwane na Wysp Południowych z nieznanych powodów. Wiedząc, że południowe obszary były bezwartościowe, Tahu założył, że Teridax planuje coś wyjątkowego. Toa Ognia następnie wyznaczył agentowi żeby zebrał wszystkich żywych Toa i prowadzić ich na Południowe Wyspy, gdzie mogliby zrobić zasadzkę i zniszczyć legiony.
Kiedy Teridax wylądował na Bara Magna w formie robota, spotkał się z Mata Nui'm, który kontrolował Prototypowego Robota. Mata Nui wyzwał Makutę i rozpoczęła się walka między nimi. Mata Nui uderzył Teridaxa, co spowodowało ogromne trzęsienia ziemi i wstrząsy całego Wszechświata Matoran. Na Południowych Wyspach, Rahkshi i Skakdibyli zgromadzeni, a kiedy dotknęło ich trzęsienie ziemi złamali formację. Jednak szybko się przegrupowali. Cały czas byli obserwowani przez Tahu i Takanuvę. Następnie Toa podążyli za wrogiem dalej na południe. Na powierzchni Bara Magna, Glatorianie zaczęli atakować robota Teridaxa, koncentrując ich ogień Thornaxów na nodze mechanoida. To nie miało wpływu, a Glatorian Gresh przeniósł się bliżej szukaj wejścia do Wszechświata Matoran, planując wejście wraz z innymi Glatorianami i zniszczyć robota od środka. Gresh znalazł wejście na jednej z nóg Teridax i przygotował się do wysadzenia go, ale zanim zdążył to zrobić, armia Rahkshi i Skakdi wyszła z luku i zaczęła atakować Glatorian. Podążając za siłami Makuty, Takanuva i Tahu wyszli i zostali przywitani wybuchem tornada od Gresha. Jednakże Glatorian i Toa szybko uświadomoli sobie, że są po tej samej stronie i postanowili połączyć siły przeciwko Skakdi i Rahkshi. Następnie zostali oni poprowadzeni przez grupę wojowników, którzy również przybyli do walki z sługusami Makuty. |
Tahu i Takanuva opuszczają Wszechświat Matoran za hordą Rahkshi
Tahu, po wyjściu z Wszechświata Matoran i został przywrócony do swej formy Toa Mata przez Ignikę, oraz otrzymał misję założenia Złotej Zbroi i zniszczenia wszystkich sił Teridaxa na Bara Magna. Wyczuwając moc Złotej Zbroi, Teridax rozrzucił ją na cały świat.
| Uwaga, Spoiler: Zapoznanie się z poniższymi materiałami może zmniejszyć lub całkowicie zlikwidować przyjemność wynikającą z poznawania historii! |
| Podczas bitwy między Makuta i Mata Nui'm, Mata Nui uderzył Makutę gromem czystej energii w to samo miejsce co poprzednio, spowodowało to szkody w robocie Wielkiego Ducha. Stopione rurociągi protodermis zostały zerwane w robocie, powodując awarie systemów. Visoraki zostały wysłane w celu ograniczenia szkód. |
Teridax zostaje uderzony fragmentem Aqua Magna
Teridax następnie wezwał falę grawitacyjnej energii, który zamierzał wykorzystać do zniszczenia Bara Magna. Jednak Mata Nui'emu udało się przekierować falę, który uderzyła w Bota Magna i Aqua Magna, ściągając księżyce w kierunku planety. Tymczasem Tahu, który dozyskał części Złotej Zbroi, użył jej do spalenia Kraata wewnątrz Rahkshi i pokonał ich wszystkich, co wstrząsnęło i osłabiło Teridaxa. Z ostatecznym ataku, Mata Nui popchnął Teridaxa w stronę nadlatującego fragmentu Aqua Magna, który uderzył go w głowę, niszcząc Rdzeń Procesora. Uszkodzenia jego systemów ostatecznie zabiły Teridaxa, obalając tyrana. Wszechświat Matoran, robot upadł na ziemię, a wielu jego mieszkańców wyszło na nową planetę Spherus Magna, która została następnie przywrócona do życia przez moc Prototypowego Robota i Kanohi Igniki.